阿里巴巴和螞蟻金服沒有股權關系，但存在業務關系，螞蟻金服的控制人是馬云，而阿里巴巴的控制人是阿里合伙人。

2011年6月中旬，阿里巴巴集團將支付寶的所有權轉讓給馬云控股的另一家中國內資公司。起因據支付寶申明解釋說，是因為央行關于非金融機構的支付管理辦法規定，要想拿到支付牌照，對公司的外資絕對控股情況有一定要求，支付寶此前接近70%的股權被美國雅虎和日本軟銀公司控制。

2011年7月29日，阿里巴巴集團、雅虎和軟銀，就支付寶股權轉讓事件正式簽署協議，支付寶的控股公司承諾在上市時予以阿里巴巴集團一次性的現金回報?；貓箢~為支付寶在上市時總市值的37.5%（以IPO價為準），回報額將不低于20億美元且不超過60億美元。

從歷史沿革看，螞蟻金服的前身是支付寶。歸屬于浙江阿里巴巴電子商務有限公司。在2014年的時候，以支付寶為基礎成立了螞蟻金服，螞蟻金服的全稱是浙江螞蟻小微金融服務集團有限公司，這兩家公司從結構上無關，但是在經濟上是有關聯的。

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