阿里巴巴和螞蟻金服兩者目前沒有持股關系，但是有收益關系。

首先，馬云團隊是先創立了阿里巴巴，通過經過多年的努力，中間經過了日本首富孫正義的軟銀、美國雅虎等國際資本的投資，逐步發展成為國內第一，全球居前的電商巨頭企業。

雖然馬云團隊以合伙人的制度依然控制著阿里巴巴的管理器，但是畢竟馬云團隊持股的比例并不高，阿里巴巴的最大的利潤最大受益者是孫正義的軟銀、美國雅虎等國際資本，參考阿里巴巴在美國上市初期的IPO結構：軟銀集團持股32.4%、雅虎持股16.3%、馬云7.8%、蔡崇信3.2%等。

也許是國內支付安全和監管的考慮，為了支付寶更好地發展，2009年和2010年，馬云通過運作，先后兩次共花了3.3億元人民幣將支付寶這塊業務從阿里巴巴旗集團下剝離，并裝入自己持股80%的浙江阿里巴巴電子商務有限公司，著力發展支付寶在國內支付市場。2014年10月浙江阿里巴巴電子商務有限公司宣布以其為主體創立了螞蟻金服，并在此后的A輪融資和B輪融資中引入全國社保基金、國開金融、中國人壽（601628）、中郵集團等國家隊，螞蟻金服亦逐步形成支付寶、余額寶、芝麻信用、借唄、用唄等在國內影響深遠的普惠金融業務。

所以，目前的阿里巴巴和螞蟻金服實際上是沒有持股關系的，但是當初馬云將支付寶從阿里巴巴剝離時曾經簽訂過協議，規定支付寶在上市前需要每年向阿里巴巴“納貢”支付49.9%的稅前凈利潤，如果支付寶上市則還需要向阿里巴巴集團支付上市時總市值的37.5%，并規定不低于20億美元，不高于60億美元。

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