上海復旦大學參股的上市企業有中國高科（600730）和復旦復華（600624）。

中國高科集團股份有限公司是由全國174所高等院校及單位投資入股組建的新型高科技企業。從事生物醫藥、電子、通訊等高新技術領域的實業投資、創業投資及國內外貿易。

2016年1月11日，公司控股股東方正集團通過上海證券交易所交易系統增持公司部分股份，增持數量為102，984股，占公司總股本的0.02%，增持金額為1，586，880.31元。本次增持前，方正集團持有公司股票數量為117，380，000股，占公司總股本的20.01%。

上海復旦復華科技股份有限公司是一家主營醫藥、軟件與園區房產等所屬行業為綜合類的公司。公司主要從事：電腦系統、通訊設備、自動化儀表、生物技術、光源照明等產品的研制及生產銷售。

截至2018年12月31日止，本公司累計發行股本總數68，471.2010萬股，注冊資本為68，471.2010萬元。

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