HIV有高變異性，在傳播過程中，常發(fā)生結構和功能的變化，使得原本有效的藥也不管用了。其次，HIV藏身深，所有接受強化治療的艾滋病病毒攜帶者，在停止治療后身體中很快又重新出現(xiàn)艾滋病病毒。

不止如此，也沒有預防艾滋病的有效疫苗。HIV為逆轉錄病毒，而逆轉錄酶缺乏校正修復功能，因而HIV的變異頻率非常高，高的變異頻率使世界不同地區(qū)甚至同一感染個體不同時期HIV的基因組都有較大差異，這就導致了從基因角度研制疫苗的困難。