1、分工不同：

業務部門又稱實作部門，是行政組織中實際執行業務及推動工作之部門，即擔任直接完成組織目標的工作單位，職能部門是組織中對下屬單位具有計劃、組織、指揮權力的部門。

2、對接不同：

業務部門是企業對外溝通與交流的部門，執行由職能部門安排的工作，職能部門是企業對內部工作安排的部門。

3、管轄范圍不同：

業務部門一般受職能部門指導和管轄，職能部門一般指按職能劃分的部門，多指管理部門，在公司體系中承擔著一定的職責。 

總結：

首先，業務部門又稱實作部門，即擔任直接完成組織目標的工作單位，職能部門是組織中對下屬單位具有計劃、組織、指揮權力的部門。

其次，業務部門是企業對外溝通與交流的部門，執行由職能部門安排的工作，職能部門是企業對內部工作安排的部門。

最后，業務部門一般受職能部門指導和管轄，職能部門一般指按職能劃分的部門。

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