第二層是國家重點建設大學，包括北京理工大學、北京師范大學、復旦大學等9所學校。

第三層是985一期工程大學，包括北京航空航天大學等除了前兩個層次的23所大學。

第四層是985二期工程大學，包括國防科學技術大學、中國農業大學、中央民族大學、西北農林科技大學、華東師范大學5所大學。

第五層是部級211一期工程，包括北京交通大學等37所學校。

第六層是部級211二期工程，包括東北林業大學等8所學校。

第七層是省級211一期工程，包括安徽大學等23所學校。

第八層是省級211二期工程，是鄭州大學。

第九層是省級211三期工程，包括海南大學等5所學校。

第十層指教育部以前確定的全國重點建設的高校，現在其地位已經逐漸被211工程取替，以前是全國重點大學現在不是211工程大學的學校目前包括大慶石油學院等10所學校。

第十一層省部共建高校，即教育部分別與中西部地區無教育部直屬高校的12個省（區）各共建1所地方高校的?。▍^）部共建規劃。

而井岡山大學、延安大學等因為特殊的政治地域等原因，被納入到省部共同重點支持高校序列，列為第十二層次。

其它部委屬院校被列為第十三層次，如外交部、國家民委等所屬的高校。

第十四層的56所轉制院校是指原來由國家各部委管理的高校轉為由地方政府管理的高校。

剩余的422所普通本科院校被列為第十五層次，它們是中國高等教育的重要組成部分。

獨立學院、民辦本科獨立學院，把它們列為第十六層次。

第十七層次是民辦本科。

第十八層次國家首批示范性高職院校，包括長春汽車工業高等?？茖W校等28所學校。

第十九層次國家第二批示范性高職院校，包括安徽水利水電職業技術學院等42所學校。

第二十層次國家第三批示范性高職院校，包括包頭職業技術學院等30所學校。

第二十一層次國家擬培育示范性高職院校，包括安徽機電職業技術學院等8所學校。

第二十二層次公辦高職院校共804所

第二十三層次民辦高職院校共260所。